酵母雙雜交系統(Yeast two hybrid,Y2H)是一種常用的方法,用于研究兩種蛋白質之間的相互作用。通過將兩種蛋白質分別克隆到酵母表達質粒中的轉錄激活因子的DNA結合結構域(DNA-BD)和轉錄激活域(AD)上,構建成融合表達載體,可以實現對這兩種蛋白質相互作用的分析。
pGBKT7是一種酵母雙雜交bait表達載體,旨在表達GAL4 DNA結合結構域(DNA-BD,1-147 aa)與bait蛋白質的融合蛋白。而pGADT7則是另一種酵母雙雜交表達載體,用于表達GAL4激活結構域(AD, 768-881 aa)與目的蛋白的融合蛋白。這種系統提供了一種有效的工具,可以幫助研究人員深入了解蛋白質間的相互作用機制。
一、酵母感受態細胞制備
(1) 將-80℃保存的酵母菌株在YPDA固體培養基平板上劃線,30℃培養條件下倒置培養4-7d。
(2) 挑取單菌落至含3mLYPDA液體培養液中。
(3) 30℃培養,200rpm 震蕩培養8h。
(4) 當菌液OD值約為0.3時,轉移10uL菌液到含50mIYPDA培養液中。
(5) 30℃培養,200rpm震蕩培養16-20h至OD值為015-0.3。
(6) 700g轉速5min室溫離心收集細胞。
(7) 將底部沉淀使用已預熱至30℃的100mLYPDA中重懸酵母細胞。
(8) 30℃,200rpm,搖3-5h至OD值=0.6時。
(9) 5min室溫離心收集細胞。
(10) 將底部沉淀在30mL無菌超純水中重懸酵母細胞.
(11) 700g轉速5min室溫離心收集細胞。
(12) 將底部沉淀加入3mL的1.1XTE/LiAc重懸細胞。
(13) 將懸重懸細胞分成2管,6000g轉速室溫離心30s。
(15) 將底部沉淀加入500uL的1XTE/LiAc重懸酵母細胞,分裝為100uL每管。
二、轉化
(1)在干凈的1.5 mL的離心管中并振蕩混勻。
(2)每個離心管中加入100 μL的酵母感受態細胞,500 μL的PEG/LiAc溶液,加入兩種質粒,并且將管中的混合物進行旋渦振蕩,將其混勻。
(3)在30℃,220 rpm/min的搖床振蕩培養30 min。
(4)往每個離心管中加70 μL的DMSO,并溫和的上下顛倒混勻。將離心管在42℃水浴中熱激40 min(每隔10 min搖勻1次)。
(5)取出離心管,在冰上靜置2 min。
(6)吸取100 μL并涂布在相應的二缺固體培養基上,培養3-4天,待菌長好后,挑單菌落于10ulYPDA液體培養基中,30℃培養過夜。
互作驗證:
取過夜培養的菌液涂布于四缺平板上,將培養皿置于30℃恒溫培養箱中培養,觀察是否生長與顏色變化。
注意事項:
(1)檢測感受態細胞效率,標準操作規范。
(2)注意質粒使用量,檢查儀器狀態。
(3)配制新鮮培養基,并做對照轉化,添加抑制劑,同時增設嚴格的對照組防止自激活。
(4)應挑選大的、新鮮的菌株克隆進行培養。